Ce n'est pas à cause des pets qu'une soupape brulera, c'est plutôt l'inverse.
Dans ton cas, si la moto ne pêtait pas plus que ça avec l'origine, il faut qu'elle soit devenue très pauvre avec le nouvel échappement, si pauvre que la richesse ne puisse plus étre adaptée par le calculateur.
Bizarre.
Ou alors, elle pêtait plus que tu ne l'avais remarqué avec le pot d'origine, dans ce cas il est possible qu'une soupape ne ferme plus complètement depuis un certain temps.
Pour ma part, avec le pot d'origine, très rares sont les pêtouilles à la decéleration.
Je te conseillerais donc de faire vérifier tes jeux aux soupapes.